June 1, 2012

東大医・代謝生理化学の栗原です。
今年度から公募で参加させていただきますのでよろしくお願いいたします。

 私はもともと循環器内科で、当時発見された血管収縮因子エンドセリンのノックアウトマウスを作成して生体での機能を明らかにしようというのが最初の仕事です。思いがけず心血管・顎顔面の形態異常が出現したため、発生の世界に参入しました。
 幹細胞の分化メカニズムの研究では、マウス着床前胚でリプログラミングが起こる中、インプリンティング遺伝子や繰り返し配列のメチル化の維持を担う酵素が卵細胞型DNAメチルトランスフェラーゼ1(Dnmt1o)ではなくて(これは他の論文)、実は体細胞型Dnmt1であることを示しました。
 また、神経堤細胞由来組織の形態形成のメカニズムを追う中で、lncRNAEvf2に遭遇し、何かとても面白いことが見えてくるのではないかとわくわくし(詳しく書くと申請書になってしまうので、一言で書いたらこのフレーズになりました)、RNAの分野に足を踏み入れました。形態形成をアウトプットにlncRNAの作用機序の一端を明らかにしようとしています。
 あっという間に10日後になってしまったCDB meetingで、皆様とお話しできるのを楽しみにしております。

医科歯科大学の浅原です

皆様、こんにちは。医科歯科大学の浅原です。

本年度から、公募で参加させていただきます。どうぞよろしくお願いいたします。

昨年6月より、東京医科歯科大学の医学部に分野(システム発生・再生医学)を新設いただいて、先月ラボも完成しました。ラボは御茶ノ水からすぐの高層ビルキャンパスの25階に位置し、スカイツリーもよく見えますので、皆様ぜひお立ち寄りください。

私は、留学先のMarc Montminyラボで転写の研究を学んで以来、遺伝子発現を通じて生物学、医学を知りたいと思っております。転写因子を網羅したマウスの発生期のWISHカタログを作っている中で、今回の課題である、RNA階層で発生を直接制御する因子に興味をもつようになりました。

憧れは今も昔も泥臭い生化学と病理組織学ですが、ハイスループットかつハイエンドのアッセイ系からデータを蓄積・共有し、そこから帰納・演繹する研究手法の構築を医科歯科でのミッションとしており、ぜひ今回もRNA研究にそうした戦略を持ち込むことができればと思います。

整形外科あがりということもあって、筋骨格系をモデルとして成果をアウトプットとすることが多いのですが、ハードコアサイエンスの極み、RNA研究の仲間にいれていただいたからには、よりジェネラルな研究成果をめざして頑張りたいとおもいます。

May 30, 2012

H24~H25の公募班に参加させていただきました東京大学アイソトープ総合センターの秋光です。どうぞ、よろしくお願い致します。
 さて、昨夜(5/29)はひどい暴風雨でしたが、今朝は打って変わって爽快な風が光っています。学内でも、色付き始めた紫陽花が朝日に負けないように明るく輝いています。紫陽花と言えば、学生のころ、薬用植物学の教科書の隅の豆知識欄に「恋人であったお滝さんの名前にちなんで、シーボルトは紫陽花に Hydrangea otaksa (確か、「お滝さんの水盤」という意味だと書いてあったと記憶しています)という名前を付けた」と書いてあったのを読んだとき、シーボルトとはなんと粋な御仁かと感心したものです。シーボルトのような文学的想像とは程遠いですが、紫陽花を見るたびに、私は勝手に核内構造を想像してしまいます。核内には、スペックルや核小体などの様々な構造体がまるで紫陽花の花弁のように存在しています。そして、核内構造体の中には特有のノンコーディングRNAを含んでいるものがあり、この核内構造体中のノンコーディングRNAに私は興味を持っています。これら核内に咲く花びらの間をノンコーディングRNAがどのように遊んでいるのか、そして、その一生をどのように終えているのかを調べて行きたいと思っています。これから二年間をどうぞよろしくお願い致します。

May 28, 2012

RNA学会会報


今週発行のRNA学会の会報。素敵な文章が色々な方々から寄せられていますので、皆さん是非ご覧下さい。超大型新人も登場しています。学会ホームページからも電子版を見ることが出来ます。とりあえず、恒例の会長の巻頭言、ここでも紹介させていただきます。皆さんどう思われますか?個人的には、春さんも最後に触れておられますが、「今時」の若者のポテンシャルに勇気づけられることは多いです。今が悪いのなら、それを変えれば良いだけですから。

中川


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巻頭言「終わりの始まり」、それとも「始まりの終わり」


塩見春彦

最近、あちこちで「ニッポンの衰退」が話題にのぼる。同僚たちはソニーの長い低迷 (’ていたらく’) に代表される産業技術の衰退に関して、熱く持論を語る。「なぜiPhoneはニッポンで生まれなかったのか?中身はほとんどニッポン製だろ、あれって」とか、「なぜ次世代シーケンサーはニッポンで生まれなかったのか? 既製品の組み合わせだろ、あれって?」とか、さらには「技術はあるはずのニッポンで、なぜグーグルやマイクロソフトやアップルのような新しい企業が生まれないのか? それって、つまり、技術が生み出す可能性にチャレンジすることを支える仕組みがニッポンには無いってこと?」とか、「敗戦後、“奇跡の経済発展”を遂げたのに、ノーベル経済学賞をもらった日本人が一人もいないのはなぜ? 経済の発展に理論は不要? もともと発展のための理論が無かったので、悪くなった原因もわからない?」とか。また、彼らは大学と基礎研究の地盤沈下に関しても同様に熱く語る。多くの人々の共通の思いは、どうやら「つい最近まで、経済も産業もそして“サイエンス”もニッポンはいつもアメリカに次ぐ2番だったのに、この10年 (人によっては20年) で急速に劣化してしまった、もはや2番ではない、3番でもないかもしれない、10番以内に留まっているのかどうかも怪しい、どうしちゃったんだろう?なぜ、そうなったんだ?」

さて、本当に日本のサイエンスは低迷しているのでしょうか? どうやら、残念ながら、日本から発表される研究論文の数と質が明らかに低下している、少なくとも停滞している、したがって相対的に他国 (特に欧米諸国と中国と韓国) に比べて低下していることは間違いないようです。最近、「我が国の学術の国際競争力の低下」を示す各種解析データ (発表論文数や被引用度の国際比較等) が国立情報研究所や文部科学省科学技術政策研究所といった (名前からして、信頼性のありそうな) ところから出されています。さらに、たとえば、nature publishing index 2011 ASIA-PACIFICというのを見ていると、以下の文章が目に留まります。
Even though the gap between Japan and China is substantial, China continues to increase the number of articles it publishes in Nature journals at a faster average rate than any other country in the top five, year on year, and may reach Japan within the decade.

私にもニッポンが中国に10年以内に追いつかれ、追い越されることは、容易に想像がつきます。この数年毎年中国に行く機会がありますが、Chinese Academy of Sciences (CAS) の各研究所やNational Institute of Biological Sciencesは建物 (建物も敷地も広く、りっぱで美しい) もその中の設備 (お金かけている、しかも卓球やバドミントンをするスペースもある) もそこで働いている人々も素晴らしい。PIにはアメリカでPhDを取得し、ポスドクを経てAssistant Professorレベルの比較的若い人々を厚遇 (税や住居取得等に優遇措置) でリクルートしています。このような帰国中国人は少し前まで「海亀/Haigui」と呼ばれていました。ソウルにも何度か行く機会がありましたが、Seoul National UniversityやKorea Universityのキャンパスは素晴らしく広くて美しい。

ニッポンにはなにか足らないものがあるのでしょうか?

たとえば、国際化。中国からアメリカへの留学生数は2010年度に前年度23%増の約15万7千人。一方、日本からアメリカへの留学生数は2万1千人、しかも年々減少して90年代の半数以下になったそうです。アメリカで学ぶ韓国人留学生は7万5千人。しかも、韓国から中国への留学は6万4千人と他国を圧倒して一番。2010年現在、Seoul National Universityは20%の授業を英語で教えており、KAISTでは2007年時点で既に100%英語で教えているそうです。さらに、韓国の大学院生の数は23万人と日本 (18万人) よりも多く (ちなみに韓国の人口は日本の3分の1強) 、一方、2004年に外国人留学生受け入れを推進するStudy Korea Project政策を打ち出し、2008年までに既に5万人の外国人留学生を受け入れ、さらに、今年までに10万人を受け入れるという政策を推し進めています。つまり、「韓国が日本を凌駕して学生のモビリティを高め、教育言語の英語化を徹底し、米中を中心に国際人材育成に邁進している」(『学術の動向』2012年2月号横田雅弘) という状況が見て取れます。私のアメリカ留学経験から言えることは、“アメリカにおける留学生は世界の研究者ネットワークの源”であるということです。このネットワークに組み込まれることの意義 (またはメリット) は大きいと思います。上に挙げた統計は、このネットワークの中にいる中国人や韓国人が増え、その外に置かれる日本人が増えていることを意味しています。
たとえば、大学キャンパス。日本の大学はどこも狭くてみすぼらしい。留学生や外国人ポスドクを惹き付ける魅力は少ない。たとえば、授業料。博士課程の学生から授業料をとる国は日本以外それほどありません。このことを私が組み込まれている『世界の研究者ネットワーク』の人々に話すたびに、とても驚かれます (That’s crazy!!)。博士課程の無料化は人材の確保、したがってサイエンスの質を高める重要かつ具体的な方法だと思えます。他にもいろいろ足らないものがありそうです。おそらく、人それぞれ熱く語ることのできる持論を持っているのではないでしょうか。ただ、重要なことはサイエンスの質を高める具体的な可能性にチャレンジすることを支える仕組みを確保する、または新たに作り出すということだと思います。独法化以後、大学教員が研究に充てる時間は2010年までに10%減少したそうです。つまり、独法化のネライは、研究時間を削り、教育と他の業務 (一般に、“雑用”と呼ばれています) に充てさせることだったということになります。

でも、ダメなことばかりでもなさそうです。『内向き』というのが、最近の日本人を表現するのによく使われる言葉ですが、私の印象では、海外で自分のラボを持つ日本人の数は増えているように見えます。また、しっかりした英語の発表をする若者は確実に増えています。一方、留学しなくても、英語が話せなくてもノーベル賞に値するサイエンスができることも証明されました。グローバル化 (つまり、アメリカ化) の時代だからこそ、日本語独自の発想が必要とされるかもしれません。ただし、日本語の可能性を活かすには日本語の達人にならなければなりません。益川敏英さんは明らかにとても熱心な文学青年でした。その発想の芯にあるのはしっかりした日本語だったと思いたい。

A pessimist sees the difficulty in every opportunity; an optimist sees the opportunity in every difficulty. - WinstonChurchill

May 25, 2012

埼玉大学の村上です


埼玉大学の村上です。


簡単に自己紹介させていただきます。私は、細胞周期制御に興味を持ち、分裂酵母を使って、どのように細胞周期が制御されているかについて、体細胞分裂と減数分裂の両方について研究しています。なので、非コードRNAとの出会いは偶然によるものでした。
 最近では、減数分裂の細胞周期で、分裂酵母で古くからその存在が知られていたMei4というフォークヘッド型転写因子の変異株に興味を持ち研究をしていました。この変異株はかなり古くから知られているだけあって、非常に「きれいな」表現型を示します。「きれいな」というのは、たとえば「この因子は第一減数分裂に必要です」と言っても、実際はただ第一減数分裂が遅れたりするだけだったり、一部のみだったりするのですが、このMei4の破壊株は100%第一減数分裂に進行しません。では、何で止まってしまってるのだろうと思って調べてみると、細胞周期の進行に必須のcdc25+という遺伝子の転写に必要であることがわかりました(2007年に発表)。その後、Mei4がどのような遺伝子の転写制御をしているかというのを、東大の白髭さんにお願いしてDNA鎖をセンス鎖とアンチセンス鎖を区別できる方法でタイリングアレイをやってもらいました。解析すると、‘Mei4で制御され、減数分裂に特異的にスプライシングされる遺伝子’のほとんどすべてにアンチセンス鎖が発現していることを見つけました。しかも、ほぼ100%で一致していたので、アンチセンス鎖が減数分裂特異的スプライシングに何か重要な役割を果たしているのではないかと思い、興奮気味に研究計画を書きました。そして、非コードRNA分野での実績はありませんが、公募で採択されたので非常にラッキーだと思っています。また、研究計画には書いていませんが、自分が研究している遺伝子の近傍に非コードRNAが発現していることがわかったので、その研究も同時に進めて行き、皆様にアドバイスをしていただけたらありがたいと思います。
 余談ですが、1年前に名古屋市立大学から埼玉大学に移動しました。関東には14年ぶりですが、埼玉にはほとんど来たことがなかったので、未だに不慣れです。これからよろしくお願いします。


May 23, 2012

東北大 萩原

東北大学多元研の萩原です。今年度から公募班に参加させていただくことになりました。

私の専門は、生体分子の化学です。設計した分子を華麗に合成し、それが予想通りにうまく機能すると、素晴らしい達成感が得られます。これまでに、ミスマッチ塩基対を持つDNAに結合する分子、糖鎖・糖ペプチド、脂質二重膜に孔をあける人工分子などを作ってきました。現在は、標的のRNAと二本鎖を組むと共有結合を形成して非可逆的に結合する人工核酸を開発しています。この人工核酸は、使い方しだいで様々な応用が期待でき、非コードRNA研究においても色々な用途があるのでは、と考えております。皆様の研究において、もし何かお役に立てそうな事があれば、ぜひお声掛けください。

これからお世話になります。よろしくお願いいたします。

May 21, 2012

高知大学の清澤です

皆さま、

高知大学の清澤です。

今年から公募班に参加させていただくことになりました。非コードRNAの研究を開始したのは、2000年頃、理研ゲノム科学総合研究センターでマウス遺伝子エンサイクロペディアプロジェクトに参加していたとき、タンパク質をコードしないcDNA配列の多さに興味を持ったのがきっかけです。

当時はまわりにそのようなものに興味をもっている人も少なかったため、非コードのうちでもアンチセンス鎖の転写と予測さるものに的を絞り解析を開始しました。また、まわりの人になかなか興味を持ってもらえなかったのは、実際のデータのうち、本当に「ジャンク」、もしくはartifactと思われるものも多かったのが理由かも知れません。

私自身は同時にゲノム刷り込みという現象にも興味をもっていたので、ゲノム刷り込みが見られる遺伝子座におけるアンチセンスRNAを調べていたところ、Ube3a遺伝子につきあたりました。更にUbe3a遺伝子は神経細胞特異的に母親由来のみの発現を示す組織特異的なゲノム刷り込み遺伝子であることを知り、その刷り込みが起きるメカニズムを解析したいと思い、in vitroの系をつくることを思い立ちました。遺伝的多型を有する亜種間雑種のES細胞を樹立したのが2005年頃で、共同研究ベースで神経細胞へ分化を試みたのですがなかなか129/sv由来のES細胞の様に神経細胞に分化せず、(常にこればかりやっていたわけではありませんが)再現性をもって分化させることが出来るようになるまで数年を要しました。

今回の研究申請ではこの神経細胞への分化系を用いて、アンチセンス/ncRNAの解析を行っていきたいと思っています。よろしくお願い致します。

清澤